Por el momento existen dos opciones:

1. Régimen de Emisión de Comprobantes Electrónicos (R.E.C.E.): Permite autorizar Facturas A y B para Responsables Inscriptos mediante Web Services, aplicativo AFIP SIAP RECE o servicio por clave fiscal "Comprobantes en linea" (máximo 100 comprobantes)
2. Régimen de Emisión de Comprobantes Electrónicos en Línea (R.C.E.L.): Permite autorizar Facturas A y B para Responsables Inscriptos (máximo 100 comprobantes) y Facturas C para monotributitas, solo por el servicio por clave fiscal "Comprobantes en linea"

Esta interfaz PyAfipWs y el aplicativo PyRece (y en general todas las soluciones de factura electrónica de terceros) solo funciona mediante web services (RECE), por disposiciones normativas no es posible adaptarlos al RCEL.

Más información en el sitio de  AFIP - eFactura